Здание 12 Коллегий-масштабный проект Петра I, решившего объединить основные правительственные Коллегии в одном здании. Можно сказать, что это был первый значительный правительственный квартал, который должен был заменить систему приказов, находившихся в Москве. Петровские коллегии, являющиеся высшими управленческими органами в России здесь состояли из:
1. Иностранная Коллегия, созданная в 1718 году (аналог Министерству иностранных дел)
2. Военная коллегия (аналог Министерству обороны)
3. Мануфактур-коллегия (аналог Министерству промышленности)
4. Адмиралтейств-коллегия (управление военно-морским флотом и военно-морским строительством)
5. Коммерц-коллегия (аналог Министерству торговли)
6. Юстиц-коллегия (апелляционный суд по гражданским и уголовным делам)
7. Штатс-контор-коллегия (аналог Министерства финансов)
8. Берг-коллегия (аналог Министерства горнорудной промышленности)
9. Камер-коллегия (аналог Министерства налогов и сборов)
10. Ревизион-коллегия (аналог Счетной палаты или Контрольно-ревизионного управления)
11. Главный магистрат (начальство над городскими магистратами других российских городов)
12. Вотчинная коллегия (ведала раздачей и регистрацией поместий и вотчин, оборотом земель)
Архитекторами такого впечатляющего проекта на первом этапе в 1722 году выступили знаменитые архитекторы итальянец Доменико Трезини и немец Теодор Швертфегер. На втором этапе строительства 1726-1732 г.г. архитекторами являлись Джузеппе Трезини и русский мастер «петровского барокко» Михаил Земцов. В 1732 году в здании прошло первое заседание одной из коллегий. 400-метровое здание условно было поделено на 12 секций, каждая в три этажа, где в каждую коллегию был сделан отдельный вход. На 2 этаже был сделан самый длинный в Санкт-Петербурге общий сквозной коридор, являющийся связующим между всеми коллегиями.
Новый этап жизни здания наступил в 1804 году, когда коллегии стали заменяться министерствами и уезжать в другие городские здания — здание на набережной стал занимать Педагогический институт. Еще через 31 год, в 1835 году здание по указу императора Николая I передали созданному Санкт-Петербургскому университету. Для нужд Университета провели реконструкцию по проекту архитектора Аполлона Щедрина. Интересно, что сквозной коридор был устроен по принципу парадной галереи, где вдоль стен были устроены шкафы с книгами и пособиями из библиотеки Университета, а также образцами минералов.